Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF4Q8WZA2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms