Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSKUQ8WUA8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms