Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms