Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARRDC4Q8NCT1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms