Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FSIP1Q8NA03 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms