Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMER3Q8N944 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMER3Q8N944 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMER3Q8N944 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMER3Q8N944 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMER3Q8N944 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMER3Q8N944 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms