Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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