Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL34Q8N239 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL34Q8N239 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms