Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF2Q8IX21 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms