Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFNL1Q8IU54 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms