Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms