Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
OTOP1Q7RTM1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms