Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms