Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HECW1Q76N89 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms