Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q71RC1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q71RC1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q71RC1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q71RC1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q71RC1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms