Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXIP1Q6ZW49 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms