Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms