Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms