Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CXCL17Q6UXB2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms