Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHISA2Q6UWI4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms