Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms