Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms