Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms