Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms