Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF544Q6NX49 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms