Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC144NLQ6NUI1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms