Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDS2

UHRF1BP1, UHRF1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1BP1Q6BDS2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1BP1Q6BDS2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UHRF1BP1Q6BDS2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms