Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms