Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms