Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFL1Q5TGJ6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms