Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD5Q5TGI4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms