Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAPCD1Q5SSQ6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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