Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HABP4Q5JVS0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HABP4Q5JVS0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms