Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms