Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3KQ59H18 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms