Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDK2Q58EX2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms