Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COBLL1Q53SF7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COBLL1Q53SF7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms