Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ANKRD39Q53RE8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms