Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL22Q53GT1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms