Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSD17B12Q53GQ0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms