Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN3Q4LDR2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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