Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVEP1Q4LDE5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms