Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms