Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEACAM16Q2WEN9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms