Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms