Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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ECM1Q16610 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
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ECM1Q16610 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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