Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms