Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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NEDD8Q15843 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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NEDD8Q15843 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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