Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ITSN1Q15811 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITSN1Q15811 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
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