Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA1Q15788 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms